Этимологический словарь Макса Фасмера
мухортый
мухо́ртый
му́хрый "гнедой с большими белыми или желтоватыми пятнами около морды (о лошади)", также "малорослый, щеголек", мухо́рт, мухо́рта, мухо́рто (Преобр.). Возм., от мох (Горяев, Доп. 2, 25). Другие пытаются обнаружить в нем *рътъ (см. рот) (Мi. ЕW 185; Преобр. I, 573). По мнению Соболевского (ИРЯ 2, 172), родственно слову тьмохортый "темно-зеленый". Неясно.
••
[Скорее всего, это результат гаплологии первонач. *мухо-хортый "светло-гнедой"; см. Трубачев, ВСЯ, 2, 1957, стр. 40. – Т.]